Тимофей Николаенко

timn аватар
Научное Звание: PhD
Дата рождения: 04.11.1987

 

 

Контакты:
Телефон: Не указано
Адрес для переписки: [email protected]

 
Личная Информация:
Страна: Украина
Город: Киев
Учреждение: National Taras Shevchenko University of Kyiv
Награды: медаль імені Михайла Білого "за особисті досягнення" (2009)

 

Образование:
магистр физики (физический факультет Киевского национального университета имени Тараса Шевченка, выпускник-2009, диплом с отличием)
к.ф.-м.н. (с 2012)

 

Научные Интересы:
  1. Конформационный анализ структурных элементов ДНК методами вычислительной квантовой механики (в пакете Gaussian)
  2. Автоматизация эксперимента

 

Избранные статьи:
  1. Структурна нежорсткiсть молекули ортофосфорної кислоти: неемпiричне квантово-механiчне дослiдження
  2. А. І. Самцевич, Л. А. Булавін, Л. Ф. Суходуб, Т. Ю. Ніколаєнко. Взаємодія нуклеотидних основ ДНК із протипухлинним препаратом ТіоТЕФ: молекулярний докінг та квантово-механічний аналіз // Ukr. Biochem. J. - 2014. - Vol. 86, N 2. - C. 50 - 59
  3. T. Yu. Nikolaienko, L. A. Bulavin, L. F. Sukhodub. The Complexation of the Anticancer Drug ThioTEPA with Methylated DNA Base Guanine: Combined Ab Initio and QTAIM Investigation // Molecular Informatics - 2014. - Vol. 33, Issue 2. - P. 104 – 114, DOI: 10.1002/minf.201300059
  4. Т.Ю. Ніколаєнко, Л.А. Булавін, Д.М. Говорун. Ефективні атомні заряди канонічних 2'-дезоксирибонуклеотидів та їхня залежність від конформації // Український фізичний журнал. – 2012. – Т. 57, № 10 – С. 1024–1029.
  5. PDF (UA)
  6. English version: T.Yu. Nikolaienko, L.A. Bulavin, D.M. Hovorun Effective atomic charges of canonical 2'-deoxyribonucleotides and their conformational dependences // Ukr. J. Phys. - 2012. - Vol. 57. - P. 1024-1029. PDF (ENG)
  7. T. Yu Nikolaienko, L. A. Bulavin, D. M. Hovorun. Structural flexibility of DNA-like conformers of canonical 2'-deoxyribonucleosides // Phys. Chem. Chem. Phys. - 2012. - Vol. 14. - P. 15554-15561, DOI: 10.1039/C2CP43120C
  8. view at publisher's
  9. T. Yu Nikolaienko, L. A. Bulavin, D. M. Hovorun. Bridging QTAIM with vibrational spectroscopy: the energy of intramolecular hydrogen bonds in DNA-related biomolecules // Phys. Chem. Chem. Phys. - 2012. - Vol. 14. - P. 7441-7447, DOI: 10.1039/C2CP40176B
  10. view at publisher's pdf
  11. T. Yu. Nikolaienko, L. A. Bulavin, D. M. Hovorun. How Flexible are DNA Constituents? The Quantum-Mechanical Study // Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. - 2011. - Vol. 29, Iss. 3. - P. 563 - 575.
  12. PDF (for limited presonal use only!)
  13. Т. Ю. Ніколаєнко, Л. А. Булавін, Д. М. Говорун. Структурна гнучкість ДНК-подібних конформерів канонічних 2'-дезоксирибонуклеотидів // Український біохімічний журнал. - 2011. - т. 83, № 5. - С. 48 - 58.
  14. PDF
  15. Т.Ю. Ніколаєнко, Л.А. Булавін, Д.М. Говорун. Структурні та енергетичні властивості молекули (3S,4R)-3,4,5-тригідроксипентаналу за даними квантово-механічних розрахунків // Ukrainica Bioorganica Acta. - 2011. - Том 9, № 1. - С. 3-11.
  16. PDF
  17. Т. Ю. Ніколаєнко, Л. А. Булавін, Д. М. Говорун. Конформаційна ємність молекули 5'-дезоксіаденілової кислоти: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини // Український біохімічний журнал. - 2011. - Том 83, №4. - С. 16 - 28.
  18. PDF
  19. Т. Ю. Николаенко, Л. А. Булавин, Д. Н. Говорун. Квантово-механическая интерпретация ИК спектра молекулы 2-дезокси-D-рибозы в области валентных колебаний OH-групп // Журнал прикладной спектроскопии. - 2011. - Том 78, №5. - С. 805-808.
  20. T. Yu. Nikolaenko, L. A. Bulavin and D. N. Govorun. Quantum mechanical interpretation of the IR Spectrum of 2-deoxy-D-ribose in the oh group stretching vibration region // Journal of Applied Spectroscopy . - 2011. - Volume 78, Number 5, 751-754
  21. doi:10.1007/s10812-011-9528-4
  22. Т. Ю. Ніколаєнко, Л. А. Булавін, Д. М. Говорун. Квантово-механічне дослідження конформаційних можливостей молекули 5'-дезоксигуанілової кислоти // Biopolymers and Cell. - 2011. - Vol. 27. N 4. - P. 291 - 299.
  23. PDF
  24. Т.Ю.Ніколаєнко, Л.А.Булавін, Д.М.Говорун. Вичерпний квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2-дезокси-D-рибопіранози // Ukrainica Bioorganica Acta. – 2010. – т.8, № 2. – С. 8–16.
  25. PDF
  26. Л.А. Булавин, Т.Ю. Николаенко, Д.Н. Говорун. Определение энергии внутримолекулярных водородных связей O–H···O по распределению электронной плотности // Вісник СевНТУ. — Сер. Фізика біологічних систем і молекул. – 2011. – Вип. 113. – С. 41–45.
  27. PDF
  28. Т. Ю. Ніколаєнко, Л. А. Булавін, Д. М. Говорун, О. О. Мисюра. Конформаційне різноманіття і фізичні властивості 1,2-дидезоксирибофуранози-5-фосфату – модельної мономерної ланки ДНК // Український біохімічний журнал. - 2011. - том 83, №1. - С. 54 - 62.
  29. PDF PMID: 21800649
  30. Т. Ю. Ніколаєнко, Л. А. Булавін, Д. М. Говорун. Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 5'-тимідилової кислоти // Український біохімічний журнал. - 2010. - том 82, №6. - С. 76 - 86.
  31. PDF PMID: 21805865
  32. Ніколаєнко Т.Ю., Булавін Л.А., Говорун Д.М. Аналіз конформаційних можливостей молекули 2-дезокси-D-рибофуранози квантово-механічним методом функціоналу густини // Biopolymers and Cell. – 2011. – том 27, №1. – С. 74 – 81
  33. PDF Abstract
  34. Булавін Л.А., Говорун Д.М., Ніколаєнко Т.Ю. Внутрішньомолекулярні водневі зв’язки та специфічні контакти Ван дер Ваальса у молекулі 2'-дезоксицитидилової кислоти: аналіз топології електронної густини // Доповіді Національної академії наук України. – 2010. – №10. – С. 166—178.
  35. PDF
  36. Ніколаєнко Т.Ю., Войтешенко І. С., Булавін Л.А., Говорун Д.М. Визначення коефіцієнтів жорсткості для колективних ступенів вільності біологічних молекул // Вісник Київського університету. Серія: фізико-математичні науки, 2010. — №2. — С. 279 – 282
  37. PDF
  38. Ніколаєнко Т.Ю., Говорун Д.М. Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти – структурної ланки ДНК // Доповіді Національної академії наук України. – 2010. – №9. – С. 173 — 184.
  39. PDF
  40. Ніколаєнко Т.Ю., Булавін Л.А., Говорун Д.М. Структурна мінливість біологічних молекул, спричинена їхніми нормальними коливаннями // Доповіді Національної академії наук України. – 2010. – № 7. – С. 61-69.
  41. PDF
  42. Ніколаєнко Т.Ю., Булавін Л.А., Говорун Д.М. Структурно-динамічні особливості модельних цукрово-фосфатних залишків 3'-дезоксирибонуклеотидів // Доповіді Національної академії наук України. – 2009. – №12. – С. 75– 82.
  43. PDF
  44. Булавін Л.А., Ніколаєнко Т.Ю., Говорун Д.М. Структурна нежорсткість молекули ортофосфорної кислоти: неемпіричне квантово-механічне дослідження // Доповіді Національної академії наук України. – 2009. – №10. – С. 80 – 87.
  45. PDF
  46. Л.А.Булавин, Т.Ю.Николаенко. Такое разнообразное жидкое состояние // Страна Знаний. — 2010. — №2. — С. 23 — 27.
  47. PDF
  48. Д.В. Соловйов, Л.А. Булавін, В.І. Горделій, Ю.Є. Горшкова, О.І. Іваньков, Ю.С. Ковальов, А.І. Куклін, Т.Ю. Ніколаєнко. Нейтронні дослідження баричної залежності структури ліпідного бішару // Ядерна фізика та енергетика. - 2012. - Т. 13, №1. - С. 83-88
  49. PDF

 

Участие в конференциях:
  1. Автоматизована установка для визначення реологічних характеристик рідинних систем / Л.А.Булавін, Т.Ю.Ніколаєнко // Тези доповідей міжнародної конференції молодих учених і аспірантів ІЕФ-2009, 25-28 травня 2009 г. - Ужгород. – С. 81.

 

Предложения Совместных Измерений:
  1. NMR spectrometer